Terrainを含むプロジェクトをbuildした際、A tree couldn’t be loaded because the prefab is missing.というbuildエラーが出てビルドできませんでした
どうやら、消したTreeのprefabがTerrainで使われていたようです。
HierarchyでTerrainを選んで、そのInspectorのTrees(をペイントするところ)でmissingになっているTreeをremoveして解決しました。
Unity2017.2.0f3
macOS High Sierra